子宫内膜异位症在治疗前要尽可能明确诊断，考虑到病人的年龄、对生育的要求、疾病的严重程度、症状和病变的范围，采用不同的治疗方法。那么主要的治疗方法有：激素治疗、手术（保守性手术、半根治性手术和根治性手术）和放射治疗。卵巢处的子宫内膜异位症应与卵巢肿瘤相鉴别，如果发现卵巢囊肿，应积极深入检查，明确诊断，以便采取适当的治疗。
子宫内膜异位症，虽然属于良性病变，但具有恶性生物学行为，因此是一种比较可怕的疾病。子宫内膜异位症是指具有生长功能的子宫内膜，出现在子宫腔以外的其它部位，绝大多数位于盆腔，以卵巢最为常见。但实际上，它可以出现在身体的任何部位，除了膀胱、肾、输尿管等内脏器官以外，手臂、大腿等处也会受到侵犯。
子宫内膜异位症在形态学上呈良性表现，但其种植、侵袭及远处转移的临床行为学特点是类似恶性肿瘤的。子宫内膜内异症是激素依赖性疾病，妊娠或绝经的情况下，雌激素分泌少，异位内膜失去了激素的支持可逐渐萎缩吸收。因此利用这个特点，临床中常使用性激素抑制卵巢的功能，包括药物、射线照射或手术切除双侧卵巢，可在一定程度上阻止疾病发展。子宫内膜异位症的发病机理还不清楚，经血逆流是主流认知，因此，经期要注意休息，保持卫生清洁，减少活动。
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痛经。患者诉说自己过去在月经期间没有痛经，但从某一时期开始出现痛经。它可以在月经前、月经期间和月经后发生。有些痛经比较严重，难以忍受，需要卧床休息或用药来缓解疼痛。疼痛往往随着月经周期的变化而加重。由于药物水平的上升，异位的子宫内膜增生和膨胀，如果受到孕激素的影响就会出血，刺激局部组织而引起疼痛。如果是内在的子宫内膜异位症，可以诱发子宫肌肉的收缩，痛经必然更加明显。如果是没有出血的异位组织，痛经可能是由血管充血引起的。月经后，异位内膜逐渐萎缩，痛经消失。临床上无痛经的子宫内膜异位症约占25%的病例。
月经量过多。在内在性子宫内膜异位症中，月经量趋于增加，经期延长。这可能是由于子宫内膜的增加，但多伴有卵巢功能紊乱。
不孕症。子宫内膜异位症患者常伴有不孕症。不孕症与子宫内膜异位症之间的因果关系仍有争议。盆腔子宫内膜异位症常可引起输卵管周围的粘连，影响卵细胞的拾取或导致输卵管管腔的堵塞。它还可能由于卵巢病变影响正常的排卵过程而导致不孕。但也有人认为，长期不孕和没有月经闭合，也会引起子宫内膜异位症；而一旦怀孕，异位的子宫内膜会受到抑制而萎缩。
夫妻生活疼痛：发生在子宫直肠窝和阴道直肠隔的子宫内膜异位症，由于周围组织的肿胀，会影响性生活，加重月经前的性不适。
大便肿胀。通常发生在月经前期或月经后。患者通过直肠排便时感到疼痛，而在其他时候则没有，这是子宫直肠窝和直肠附近子宫内膜异位症的典型症状。
