二代试管会剔除畸形精子，造成男性畸形精子的原因有很多，如泌尿生殖道感染、睾丸炎、精索静脉曲张等，都会造成男性畸形精子增加，影响精子质量，一般正常形态的精子数量越多，男性的孕育能力就越强。一般二代试管适用于严重的畸形精子多造成的畸形精子症不育，就是踢出畸形精子选择出优质的精子然后将单个精子通过显微注射的方式注入卵泡浆内，让精子和卵子被动结合受精形成受精卵。
无精子症比较复杂，要先通过检查进行分类诊断，再决定治疗方式。绝大多数的无精子症是不能单纯通过吃药来使精液中出现精子的，需要借助试管婴儿技术获得生育。
轻中度畸形精子症患者可以通过人工授精和第一代代试管婴儿技术获得生育，重度和极重度畸形精子症患者则需要采用第二代试管婴儿技术。第二代试管婴儿技术是卵泡浆内单精子显微注射的简称，是借助显微操作系统，直接将单个精子注射入卵母细胞浆内使其受精。
畸形精子症的严重程度不影响第二代试管婴儿妊娠率。只要精子内部质量是好的，有些极重度的畸形精子症，通过第二代试管婴儿技术也可以获得较高的生育妊娠率。
人工授精是指将精子通过非同房的方式注入女性生殖道中以达到使女子受孕目的一种辅助生殖技术。人工授精的过程中首先要处理男方的精液，将精液洗涤处理后，去除精浆，取3～5ml精子悬浮液，主要取得是活动度好的精子，然后再注入女性宫腔内。因此精子畸形率高的不孕夫妇可以通过人工授精来实现受孕的目的，但是如果丈夫精液正常精子所占比率太低，即存在严重的畸精子症，则人工授精的成功率太低，此时需要进行二代试管婴儿，选取正常精子进行卵母细胞胞浆内注射。
第三代试管婴儿技术又称为胚胎植入前遗传学诊断/胚胎植入前遗传学筛查，主要针对因为遗传问题导致的不孕不育，是指胚胎移植前，取胚胎的遗传物质进行分析，诊断胚胎是否存在异常，筛选健康胚胎移植，防止遗传病传递的方法。三代试管间并没有级别的高低，并不是一代比一代强，各针对不同的问题，适合自己就好。
因为试管婴儿就是把男女双方的精子与卵子取出，在进行结合培育成胚胎再放入到女性子宫内进行生长。在医院将精子与卵子结合之前，是会挑选好优质精子的。所以，理论上只要男性有精子就可以做试管婴儿。
所以，精子畸形做第几代试管这个问题需要结合自身实际的实际情况考虑，并不是说试管婴儿技术一代比一代先进，而应该根据男性畸形精子症的严重程度和其他因素综合考虑选择做第几代试管。
二代试管婴儿主要是针对男性精子问题，那么在做的过程中，成功率会更高一些，大约在50%左右。但要注意的是，精子畸形率越高，做试管成功率则会越低。具体成功率可以根据自己的检查报告，在医生的咨询下得出大概的受孕几率。
